«атеистом» по составу

Части слова: а/те/ист/ом
Часть речи: имя существительное.

Состав слова (морфемы):
а — приставка,
те — корень,
ист — суффикс,
ом — окончание,
атеист — основа слова.

Итоговая схема:
а (приставка) + те (корень) + ист (суффикс) + ом (окончание).

Дополнительно:

• Окончание: ом
  — типичное окончание существительного мужского рода, одушевлённого, единственного числа в творительном падеже.