«атомно-молекулярный» по составу

Части слова: атом/н/о/-/молекул/ярн/ый

Состав слова (морфемы):
атом, молекул — корни,
о — соединительная гласная,
н, ярн — суффиксы,
ый — окончание,
атомно-молекулярн — основа слова.