«атония» по составу

Части слова: а/тон/и/я
Часть речи: имя существительное.

Состав слова (морфемы):
а — приставка,
тон — корень,
и — суффикс,
я — окончание,
атони — основа слова.

Итоговая схема:
а (приставка) + тон (корень) + и (суффикс) + я (окончание).

Значение слова:
транскрипция - [й/а]

Дополнительно:

• Окончание: я
  — типичное окончание существительного женского рода, неодушевлённого, единственного числа в именительном падеже.