«вакуолью» по составу

Части слова: вакуоль/ю
Часть речи: имя существительное.

Состав слова (морфемы):
вакуоль — корень,
ю — окончание,
вакуоль — основа слова.

Итоговая схема:
вакуоль (корень) + ю (окончание).

Дополнительно:

• Окончание: ю
  — типичное окончание существительного женского рода, неодушевлённого, единственного числа в творительном падеже.