«водонепроницаемый» по составу

Части слова: вод/о/не/про/ниц/а/ем/ый

Состав слова (морфемы):
не, про — приставки,
вод, ниц — корни,
о — соединительная гласная,
а, ем — суффиксы,
ый — окончание,
водонепроницаем — основа слова.