«магистерский» по составу

Части слова: магистер/ск/ий

Состав слова (морфемы):
магистер — корень,
ск — суффикс,
ий — окончание,
магистерск — основа слова.

Итоговая схема:
магистер (корень) + ск (суффикс) + ий (окончание).