«пополняются» по составу

Части слова: по/полн/я/ют/ся
Часть речи: глагол

Состав слова (морфемы):
по — приставка,
полн — корень,
я, ся — суффиксы,
ют — окончание,
пополня + ся — основа слова.

Примечание: ся является словообразующим суффиксом (постфиксом) и входит в основу слова.