«стоишь» по составу

Слово имеет два разных морфемных разбора в зависимости от значения.

Части слова: сто́/ишь
Часть речи: глагол
от слова стоить

Состав слова (морфемы):
сто́ — корень,
ишь — окончание,
сто́ — основа слова.

Части слова: сто/и́шь
Часть речи: глагол
от слова стоять

Состав слова:
сто — корень,
и́шь — окончание,
сто — основа слова.