«шифровали» по составу

Части слова: шифр/ова/л/и
Часть речи: глагол

Состав слова (морфемы):
шифр — корень,
ова, л — суффиксы,
и — окончание,
шифрова — основа слова.

Примечание: л является формообразующим суффиксом и не входит в основу слова.